病毒驅(qū)動型和致癌物驅(qū)動突變型頭頸癌的免疫狀況
大家好,今天菠蘿冰給大家分享一篇22+分的學(xué)習(xí)筆記。題目:病毒驅(qū)動型和致癌物驅(qū)動突變型頭頸癌的免疫狀況。一、 分析思路我們給?家簡單解讀?下分析思路:本篇學(xué)習(xí)筆記中通過單細(xì)胞RNA測序分析和多光譜免疫熒光(IF)比較了突變驅(qū)動型和病毒驅(qū)動型(HPV+)頭頸部鱗狀細(xì)胞癌HNSCC的免疫狀況
充足的深度睡眠有助于清除大腦垃圾,但你真“睡好”了嗎?
與生物學(xué)中的大多數(shù)問題一樣,“我們?yōu)槭裁葱枰摺边@一問題可能會有很多版本的答案。事實上,科學(xué)家近年來在這一問題的相關(guān)領(lǐng)域內(nèi)也在持續(xù)不斷地進(jìn)行探索,試圖得到一個最全面的答案。近日,來自美國西北大學(xué)(N
為了躲避化療存活下來!癌細(xì)胞竟然學(xué)會了休眠!
冬眠是一種常見的生物學(xué)現(xiàn)象,在自然界中,許多動物都會通過冬眠的方式來熬過漫長的冬季,以在來年的春天復(fù)蘇,開啟下一輪春秋。在冬眠時,動物會保持著一種極端但可被調(diào)節(jié)的體溫、代謝和其它生理活動的下降,減少自身的能量消耗
喝咖啡確實能抗癌!多喝咖啡或可降低患前列腺癌的風(fēng)險
在全世界,前列腺癌(Prostate Cancer)是男性群體中第二大常見的癌癥(僅次于皮膚癌),據(jù)世界衛(wèi)生組織(WHO)2014 年統(tǒng)計報道,前列腺癌是男性與癌癥相關(guān)的第五大死因。美國疾病控制與預(yù)防
最新研究:患有PPA的人可能不會有阿爾茨海默病的記憶問題
原發(fā)性進(jìn)行性失語是一種罕見的神經(jīng)退行性疾病,其特征是突出的語言問題,隨著時間的推移會惡化。大約40%的患者有潛在的阿爾茨海默病!睹绹窠(jīng)病學(xué)學(xué)會》官網(wǎng)1月13日消息一項新的研究發(fā)現(xiàn),患有原發(fā)性進(jìn)行性
通過整合基因組分析以鑒定肺腫瘤內(nèi)皮細(xì)胞異質(zhì)性和血管生成候選物
大家好,今天要和大家分享的是今年二月份發(fā)表在Cancer Cell (IF:26.602)上的一篇文章,“An Integrated Gene Express
這篇6+分文章教你進(jìn)階疾病分型擴(kuò)展分析!
大家好,今天布丁和大家分享的是一篇6+分的學(xué)習(xí)筆記;文末閱讀原文可獲得學(xué)習(xí)筆記。題目:乳腺癌近端和遠(yuǎn)端切除的形態(tài)正常組織中四種亞型的特征一、研究背景 廣泛的乳腺X射線攝影篩查項目和改進(jìn)的自我監(jiān)測醫(yī)療體系能更早地發(fā)現(xiàn)乳腺癌,保乳手術(shù)是患病女性有成效的治療方法
長安大學(xué)張懿璞:影像遺傳腦科學(xué)研究中的HPC問題
金翅導(dǎo)讀腦區(qū)異常和遺傳變異是研究精神疾病的重要標(biāo)志。神經(jīng)成像技術(shù)為研究腦部異;顒犹峁┝擞行覠o創(chuàng)的方法,如磁共振成像(MRI)、腦磁圖(MEG),腦電圖(EEG)。隨著分子遺傳學(xué)的發(fā)展,特別是全基因組關(guān)聯(lián)分析(GWAS),極大地促進(jìn)了復(fù)雜的疾病研究
當(dāng)孤獨時,我們的大腦發(fā)生了什么變化?
日常生活中,無論是孤寡老人還是在外獨自漂泊的年輕人,一個人在獨處時往往會不自覺的思考很多事情,并感受到孤獨和備受煎熬。有研究表明,長期處于孤獨環(huán)境中,會影響我們的睡眠,對于大腦以及心血管系統(tǒng)造成不可逆轉(zhuǎn)的損傷
生發(fā)細(xì)胞激酶四激酶:保護(hù)神經(jīng)元并促進(jìn)其生長
許多神經(jīng)退行性疾病,從青光眼到阿爾茨海默病,都是以軸突損傷為特征的。軸突是一種細(xì)長的突起,將電脈沖從一個神經(jīng)細(xì)胞傳導(dǎo)到另一個神經(jīng)細(xì)胞,促進(jìn)細(xì)胞間的通訊。軸突損傷常導(dǎo)致神經(jīng)元損傷和細(xì)胞死亡。加州大學(xué)圣地
TCGA預(yù)后基因聯(lián)合免疫浸潤
通過ESTIMATE算法計算免疫,間質(zhì)和ESTIMATE得分,并以此篩選DEGs,進(jìn)行生存分析、KEGG、GO、GSEA分析,構(gòu)建PPI網(wǎng)絡(luò)并篩選hub基因,最后通過構(gòu)建風(fēng)險評分(RS)模型,研究hub基因的預(yù)后價值并用驗證集進(jìn)行驗證
非裔美國人前列腺切除術(shù)后前列腺基質(zhì)復(fù)發(fā)的計算機(jī)衍生基質(zhì)特征的圖像signature
今天螺螄粉和大家分享的是10+學(xué)習(xí)筆記。題目:非裔美國人前列腺切除術(shù)后前列腺基質(zhì)復(fù)發(fā)的計算機(jī)衍生基質(zhì)特征的圖像signature一. 研究背景數(shù)據(jù)顯示,在前列腺癌根治術(shù)后,有30%-40%的前列腺癌患者出現(xiàn)復(fù)發(fā)
如何使用Survminer包優(yōu)雅的繪制生存曲線?
生存分析是臨床上較為常用的統(tǒng)計學(xué)方法,用于比較不同組別的患者在接受干預(yù)之后,生存時間的變化情況。
技術(shù)文章:計量資料的統(tǒng)計描述
一、 計量資料的描述1、 頻數(shù)分布表收集到計量數(shù)據(jù)后,可通過資料整理,編制頻數(shù)分布表或簡稱頻數(shù)表(frequency table)來了解其分布規(guī)律。頻數(shù)分布(frequency distribution) 通常是針對樣本而言
細(xì)微塑料顆粒具有極強(qiáng)滲透性,微塑料污染已波及人類胎盤!
關(guān)于微塑料污染的話題,最近越來越受到社會各界的關(guān)注,我們只知道其分布廣泛,卻對其潛在危害知之甚少。
相關(guān)性熱圖 (ggcorrplot包)
?ggcorrplot包是基于ggplot2的擴(kuò)展包,主要針對相關(guān)系數(shù)輸出的結(jié)果進(jìn)行可視化, 同時計算相關(guān)性p-value,可以實現(xiàn)選擇顏色,文本標(biāo)簽,顏色標(biāo)簽,布局等的操作。? 相關(guān)系數(shù)的值在 -1~1之間,1表示強(qiáng)正相關(guān),0不相關(guān)
森林圖 (forestplot包)
在Meta分析中森林圖比較常見,但其實掌握了用R語言中的forestplot包繪制森林圖的各個用法,森林圖可以用于表示其他數(shù)據(jù)類型各組間的指標(biāo)的中值和四分位距的范圍。它是在平面直角坐標(biāo)系中,以一條垂直
乳腺癌或頭頸癌放射敏感性預(yù)測因子的分子分析
大家好,今天糖葫蘆跟大家分享一篇的6+分的學(xué)習(xí)筆記。題目:乳腺癌或頭頸癌放射敏感性預(yù)測因子的分子分析一、研究背景 近一半的癌癥是單獨或聯(lián)合放射治療,放療除了對癌癥的治療作用外,不可避免地涉及到正常組織的暴露,其中晚期和急性不良反應(yīng)是治療的劑量限制因素
使用DriverPower識別癌癥driver基因的綜合負(fù)荷和功能影響測試
今天跟大家分享的是2020年發(fā)表在Nat.Commun .(IF:12.121)雜志上的一篇文章Combined burden and functional
胰腺癌的放射線治療簡介
文/JMT運用化學(xué)放射線療法或化學(xué)療法治療無法切除的胰腺癌胰腺癌不僅治療困難,也是生存率最低的癌癥的一種,目前能夠根治胰腺癌的治療方法只有手術(shù)。但是,由于胰腺癌發(fā)展迅速,也有發(fā)現(xiàn)較晚的傾向,因此能夠進(jìn)行手術(shù)的病例只占所有病例的20%左右,其5年生存率也僅為13%,情況較為嚴(yán)峻
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