分子膠 + 微型標(biāo)簽 = CRISPR的“智能遙控器”!
關(guān)于分子膠作為"開關(guān)分子"調(diào)控生物活性的研究,科學(xué)界已經(jīng)積累了相當(dāng)豐富的經(jīng)驗(yàn)。正如先前在CAR-T細(xì)胞治療領(lǐng)域所展示的那樣(感興趣的朋友可參閱分子膠新應(yīng)用:給CAR-T安上可逆“安全開關(guān)”),這類小分子化合物展現(xiàn)出了精準(zhǔn)控制生物大分子的獨(dú)特優(yōu)勢(shì)。而最新發(fā)表在Journal of the American Chemical Society上的一項(xiàng)突破性研究,則將這一理念推向了基因編輯領(lǐng)域——科學(xué)家們巧妙地利用臨床常用藥物泊馬度胺(pomalidomide),為CRISPR系統(tǒng)裝上了可編程的"分子計(jì)時(shí)器"。
這項(xiàng)研究的精妙之處在于,它利用分子膠實(shí)現(xiàn)了對(duì)基因編輯活性的雙重控制:既能按需激活CRISPR-Cas9的"基因剪刀"功能,又能通過簡(jiǎn)單的藥物干預(yù)精準(zhǔn)設(shè)定其"使用壽命"。這種動(dòng)態(tài)調(diào)控機(jī)制究竟是如何做到的?其分子設(shè)計(jì)背后隱藏著哪些創(chuàng)新思維?更重要的是,這種可控式基因編輯將如何改寫治療性基因編輯的應(yīng)用前景?讓我們一起來了解一下這項(xiàng)融合了分子膠與基因編輯的前沿突破。
為什么需要控制CRISPR的壽命?
CRISPR雖然強(qiáng)大,但它就像任何精密工具一樣,需要恰到好處的使用時(shí)間才能發(fā)揮最佳的效力。過長(zhǎng)的編輯時(shí)間可能帶來三大問題:
安全性隱患: CRISPR編輯時(shí)間過長(zhǎng),可能導(dǎo)致脫靶效應(yīng),即錯(cuò)誤地編輯非目標(biāo)基因;還可能引起染色體異常,甚至觸發(fā)P53介導(dǎo)的DNA損傷反應(yīng),增加潛在的致癌風(fēng)險(xiǎn)。
免疫風(fēng)險(xiǎn):人體可能對(duì)細(xì)菌來源的Cas9蛋白產(chǎn)生免疫排斥反應(yīng)。
遞送限制: 傳統(tǒng)的CRISPR調(diào)控方法,例如通過FKBP融合引入的響應(yīng)元件,往往是龐大的蛋白質(zhì)片段(超過230個(gè)氨基酸)。這不僅可能影響CRISPR本身的活性,更重要的是,其巨大的體積會(huì)給病毒載體(如AAV)的包裝帶來困難,從而限制了CRISPR在體內(nèi)的廣泛應(yīng)用。
因此,如何精準(zhǔn)控制CRISPR的活性時(shí)長(zhǎng),即其“半衰期”,便成為了亟待解決的核心問題。
技術(shù)背景:CRISPR與分子膠的“天作之合”
要深刻理解這項(xiàng)研究的精妙之處,我們必須先回顧兩個(gè)關(guān)鍵的技術(shù)概念:
CRISPR-Cas9: 這無疑是近年來生物醫(yī)學(xué)界最令人興奮的突破。它如同一把高精度“基因剪刀”,能夠精準(zhǔn)定位并修改DNA上的特定序列。CRISPR技術(shù)家族不僅包括Cas9核酸酶,還衍生出了“堿基編輯器”(如ABE,能夠?qū)崿F(xiàn)A·T到G·C的精確轉(zhuǎn)換,有望糾正近半數(shù)的已知致病點(diǎn)突變)和“轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)器”(CRISPRi/a,用于特定基因的抑制或激活)。這些工具在多種疾病治療中展現(xiàn)出巨大潛力,但它們的精準(zhǔn)控制是確保療效和安全的關(guān)鍵。
分子膠:分子膠是一種小分子化合物,它能像膠水一樣,促進(jìn)伴侶蛋白與靶標(biāo)之間的相互作用。在這項(xiàng)研究中,科學(xué)家們巧妙地利用了分子膠,實(shí)現(xiàn)了CRISPR工具與細(xì)胞自身的泛素連接酶復(fù)合體(e.g.CRBN)的連接。
研究思路:如何用分子膠為CRISPR設(shè)置“定時(shí)器”?
設(shè)計(jì)微型“降解標(biāo)簽”(Superdegron): 研究人員將一個(gè)僅約60個(gè)氨基酸的泊馬度胺結(jié)合響應(yīng)元件(Superdegron,源自ZFP91-IKZF3蛋白)巧妙地融合到Cas9的不同位置,最終發(fā)現(xiàn)融合到Cas9的loop-231區(qū)域(LSD-Cas9)效果最佳。這一微型設(shè)計(jì)最大限度地避免了對(duì)Cas9活性的影響。
利用泊馬度胺實(shí)現(xiàn)精準(zhǔn)調(diào)控: 泊馬度胺作為一種分子膠,能夠促進(jìn)攜帶Superdegron的CRISPR工具與細(xì)胞內(nèi)關(guān)鍵的泛素連接酶CRBN的緊密結(jié)合。這種結(jié)合會(huì)隨即啟動(dòng)CRISPR工具的泛素化過程,使其被細(xì)胞的蛋白酶體系統(tǒng)識(shí)別并降解。
重要發(fā)現(xiàn):從“開關(guān)”到“精準(zhǔn)調(diào)諧”——CRISPR工具的全面可控性
Cas9的精準(zhǔn)降解與半衰期精控:泊馬度胺能夠以極高的效率和精準(zhǔn)性誘導(dǎo)LSD-Cas9降解,最快可在30分鐘內(nèi)完成,且低至12.7 nM的濃度下即可實(shí)現(xiàn)有效降解。
降解系統(tǒng)普適性: 這一創(chuàng)新的降解系統(tǒng)并非僅限于Cas9,它同樣能有效控制堿基編輯器(如ABE8e-SD6)和CRISPRi/a系統(tǒng)(如LSD-dCas9-BFP-KRAB和LSD-dCas9-VPR)的半衰期及活性,為多種CRISPR衍生工具提供精準(zhǔn)調(diào)控能力。
創(chuàng)新性“開關(guān)開啟”功能:通過降解CRISPR抑制蛋白AcrIIA4,成功激活了堿基編輯器的活性。
Cas9壽命對(duì)DNA修復(fù)路徑的關(guān)鍵影響:令人驚喜的是,Cas9的半衰期居然能顯著影響細(xì)胞內(nèi)DNA修復(fù)的途徑,進(jìn)而改變基因編輯的最終產(chǎn)物。短壽命的Cas9更有利于促進(jìn)精確修復(fù),而長(zhǎng)壽命的Cas9則更容易導(dǎo)致非精確修復(fù)(如MMEJ),可能引發(fā)大片段缺失。這無疑為基因編輯策略帶來了更廣闊的維度。
體內(nèi)驗(yàn)證:通過AAV遞送拆分式ABE8e-SD6并結(jié)合泊馬度胺,研究人員成功控制了小鼠肝臟中Pcsk9基因的編輯效率,并有效調(diào)節(jié)了血漿Pcsk9水平。
展望與挑戰(zhàn):推動(dòng)基因治療的未來
這項(xiàng)研究不僅解決了CRISPR面臨的多個(gè)核心問題,更為基因治療的未來描繪了激動(dòng)人心的圖景:
巨大的治療潛力: 這一策略能夠有效避免基因編輯工具過度活躍可能引發(fā)的免疫反應(yīng)或潛在的致癌風(fēng)險(xiǎn),顯著提升了基因療法的安全性。
卓越的通用性: 該平臺(tái)不僅適用于Cas9,還能廣泛應(yīng)用于堿基編輯器、CRISPRi/a等多種CRISPR衍生工具,展現(xiàn)出極強(qiáng)的普適性和模塊化特性。
然而,如同所有前沿的科學(xué)技術(shù),這項(xiàng)研究也面臨著一些待解決的問題:
脫靶降解: 泊馬度胺作為一種藥物,仍可能在特定情況下降解其他非目標(biāo)蛋白(例如SALL4)。但研究團(tuán)隊(duì)已經(jīng)成功開發(fā)出具有更低脫靶效應(yīng)的泊馬度胺類似物(如化合物27/31),這有望在未來進(jìn)一步減少潛在的副作用。
體內(nèi)遞送: 雖然研究展示了與AAV遞送系統(tǒng)的兼容性,但AAV包裝效率的持續(xù)優(yōu)化仍然是基因治療領(lǐng)域的一個(gè)長(zhǎng)期且關(guān)鍵的挑戰(zhàn)。
那么,這項(xiàng)技術(shù)是否意味著基因編輯療法離臨床更近了呢?
我想,答案是肯定的。這項(xiàng)突破性的研究為我們提供了一套全新的方法和工具,能夠精確控制CRISPR基因編輯工具的劑量和半衰期,這無疑將極大地推動(dòng)CRISPR在治療領(lǐng)域的發(fā)展,讓我們離更安全、更有效的基因治療又近了一步!或許在不遠(yuǎn)的將來,我們真的可以像調(diào)節(jié)藥物劑量一樣,精準(zhǔn)控制基因編輯的“劑量”和持續(xù)時(shí)間。
參考資料:Journal of the American Chemical Society 2025 147 (27), 23844-23856
原文標(biāo)題 : 分子膠 + 微型標(biāo)簽 = CRISPR的“智能遙控器”!

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